PhD in France
Offers listWhy France ?F.A.Q.Email AlertsPost an offer
or

Forgot Password ?
Offer Details


INRA 
EVOLUTIONARY HISTORY OF AUTOPHAGY RELATED GENES IN FISH
INRA-UPPA, Saint Pée-sur-Nivelle
UMR1419 NuMeA
Evolution Molecular Biology Bioinformatics 
Full Description:

BACKGROUND AND OBJECTIVES

Autophagy is an evolutionarily conserved process in eukaryotes by which cytoplasmic cargo sequestered inside double-membrane vesicles are delivered to the lysosome for degradation. This 'self-eating' process not only rids the cell of intracellular misfolded proteins or damaged organelles, but is also a key adaptive response to provide energy when nutrients are scarce. Dysregulation of autophagy has been implicated in numerous human disease such as neurodegenerative diseases, infectious diseases, and cancers.

Although research on autophagy has expanded dramatically in the past 10-15 years, it has been mainly focused on mammalian models, particularly in the context of human diseases. Due to a general lack of work with other vertebrate taxa, it still remains unknown whether the mammalian autophagy genes (atg) repertoire as well as the related expression patterns and functions is even representative of the remaining ninety percent of vertebrate species, where autophagy is just as crucial for survival. In this regard, recent findings demonstrated that while 90% of the “autophagy core” genes are conserved across all eukaryotic species, those coding for proteins involved in the recognition of substrates to be degraded by autophagy display a rather low conservation in ancient taxa, suggesting a specialization of this function during evolution. Furthermore, it is possible that the whole genome duplication occurred 300-350 million years ago in the common ancestor of teleosts (ray-finned fishes gathering 99.8% of current fish species and almost half of vertebrate species) has strongly modulated the genetic structure and therefore the function of autophagy in this group of fish compared to mammals.

In this context, the project we propose aims to characterize the landscape of atg genes (20-30 gene families) in the genome of teleost and non-teleost fish species covering a large period of the evolutionary history of vertebrate and describe their evolutionary history. The growing number of fish species whose genome was completely sequenced and recent advances in transcriptome analysis allows today to include in the study a large number of species and thus to trace the evolutionary history of autophagy-related genes.

 

REFERENCES

· Seiliez et al. (2016). Looking at the metabolic consequences of the colchicine-based in vivo autophagic flux assay. Autophagy, 12(2):343-56.

· Klionsky, D.J. et al. (2467 co-authors including Seiliez) (2016). Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (3rd edition). Autophagy, 12(1):1-222.

· Seiliez et al. (2012). Amino acids downregulate the expression of several autophagy-related genes in rainbow trout myoblasts. Autophagy, 8 (3), 1-12.

· Berthelot et al. (2014) The rainbow trout genome provides novel insights into evolution after whole-genome duplication in vertebrates. Nat Commun 5:3657.

 

REQUIRED SKILLS AND KNOWLEDGE            

Solid bases in bioinformatics and/or molecular biology are required. Knowledge in evolutionary biology will be highly appreciated. English (reading and writing) is mandatory.

 

REQUIRED DOCUMENTS

CV ; Letter of Motivation ; reports ; certificates ; contact names and addresses of references (at least two) familiar with the work of the candidate

 

APPLICATION DEADLINE: 15 April

Contact : Iban  SEILIEZ (seiliez@st-pee.inra.fr)

 



Posted on: 24 March 2016Deadline to apply: 15 April 2016Start Date: 01 October 2016 Duration: 36 months
The Fund category is Public Funding - University and the salary is 20-25k€ annual gross
Doctoral School is Exact sciences and their applications in the Aquitaine Region.

Please connect to your account to see contact details



Back to offer list

Back to home page


PhD in France Website.
© French Embassy in India, CampusFrance 2014.

Contact us

Peluang Menang di RTP Slot Gacor yang Menguntungkan

RTP Slot Gacor memang menjadi pilihan menarik bagi banyak pemain karena peluang menangnya yang lebih besar. Dengan persentase RTP Slot Tertinggi, pemain bisa merasa lebih percaya diri saat bermain dan berharap pada peluang yang lebih baik. Saat bermain di RTP Slot Online, sensasi adrenalin saat melihat peluang kemenangan yang tinggi menjadi pengalaman tersendiri. Slot RTP Tertinggi menawarkan stabilitas dan frekuensi kemenangan yang sangat dinantikan banyak pemain.

Bagi pemula atau pemain dengan anggaran terbatas, Slot Min Depo 5k adalah opsi sempurna. Permainan ini dirancang untuk memberikan pengalaman bermain yang seru sekaligus kesempatan meraih kemenangan besar tanpa harus mengeluarkan banyak uang.

Bagi Anda yang mencari platform slot yang tidak hanya menyediakan permainan berkualitas, tetapi juga memberikan pengalaman bermain yang menyenangkan, Slot777 adalah pilihan yang tepat. Dengan dukungan teknologi terkini, Slot777 menghadirkan tampilan permainan yang menarik dan mudah dinavigasi.

Jackpot Progresif dan Peluang Menang yang Menarik

Toto Slot memiliki berbagai permainan slot dengan RTP tinggi yang membuatnya sangat menarik bagi para pemain. Dengan tema yang beragam dan berbagai fitur bonus yang tersedia, Toto Slot menjamin pengalaman bermain yang seru dan menguntungkan. Tak heran jika banyak pemain yang memilih Toto Slot sebagai permainan favorit mereka.

Peluang Kemenangan Tinggi di Setiap Pasaran Togel di Togel158

Pilihan platform yang memberikan peluang kemenangan tinggi semakin terbatas, tetapi Togel158 hadir sebagai salah satu situs terbaik. Dengan sistem taruhan yang adil dan transparan, pemain memiliki kesempatan lebih besar untuk meraih hasil maksimal di setiap pasaran.

Di dunia Bandar Togel Terpercaya, kode syair sering digunakan sebagai panduan atau prediksi yang dapat membantu pemain dalam memasang taruhan. Kode syair ini biasanya disusun berdasarkan analisis dari pola-pola sebelumnya.

Tidak semua platform perjudian memiliki sistem yang adil, itulah mengapa memilih Situs Toto yang resmi sangatlah penting. Situs yang sudah berlisensi menjamin keadilan dalam setiap undian serta transparansi dalam perhitungan angka keluar. Hal ini memberikan kenyamanan dan kepercayaan bagi para pemain untuk bertaruh tanpa rasa khawatir.

Keunggulan Pasaran Togel Toto Macau dalam Pengundian yang Transparan

Memilih pasaran yang tepat bisa membuat pengalaman bermain togel menjadi lebih menyenangkan dan menguntungkan. Salah satu pasaran yang paling banyak dimainkan saat ini adalah Toto Macau, yang menawarkan berbagai keunggulan bagi para pemainnya. Dengan hasil pengundian yang transparan dan peluang menang yang menarik, banyak orang terus memilih pasaran ini sebagai tempat bermain utama mereka.

Related Links:

Togel178

Pedetogel

Sabatoto

Togel279

Togel158

Colok178

Novaslot88

Lain-Lain

Partner Links